Abstract
We performed a meta-analysis of five genome-wide association studies to identify common variants influencing colorectal cancer (CRC) risk comprising 8,682 cases and 9,649 controls. Replication analysis was performed in case-control sets totaling 21,096 cases and 19,555 controls. We identified three new CRC risk loci at 6p21 (rs1321311, near CDKN1A; P = 1.14 × 10 -10), 11q13.4 (rs3824999, intronic to POLD3; P = 3.65 × 10 -10) and Xp22.2 (rs5934683, near SHROOM2; P = 7.30 × 10 -10) This brings the number of independent loci associated with CRC risk to 20 and provides further insight into the genetic architecture of inherited susceptibility to CRC.
| Original language | English |
|---|---|
| Pages (from-to) | 770-776 |
| Number of pages | 7 |
| Journal | Nature Genetics |
| Volume | 44 |
| Issue number | 7 |
| DOIs | |
| Publication status | Published - Jul 2012 |
| Externally published | Yes |
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Dive into the research topics of 'Common variation near CDKN1A, POLD3 and SHROOM2 influences colorectal cancer risk'. Together they form a unique fingerprint.Cite this
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In: Nature Genetics, Vol. 44, No. 7, 07.2012, p. 770-776.
Research output: Contribution to a Journal (Peer & Non Peer) › Article › peer-review
TY - JOUR
T1 - Common variation near CDKN1A, POLD3 and SHROOM2 influences colorectal cancer risk
AU - Dunlop, Malcolm G.
AU - Dobbins, Sara E.
AU - Farrington, Susan Mary
AU - Jones, Angela M.
AU - Palles, Claire
AU - Whiffin, Nicola
AU - Tenesa, Albert
AU - Spain, Sarah
AU - Broderick, Peter
AU - Ooi, Li Yin
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AU - Smillie, Claire
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AU - Janson, Martin
AU - Andersson, Magnus
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AU - Olsson, Louise
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AU - Gidden, Fiona
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AU - Rees, Charlotte
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AU - McGovern, Ursula
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AU - Potter, Vanessa
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AU - Braconi, Chiara
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AU - Cummins, Sebastian
AU - Essapen, Sharadah
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AU - Iveson, Timothy John
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AU - Pledge, Simon
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AU - Adams, Richard
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AU - Kaplan, Rick
AU - Meade, Angela
AU - Parmar, Mahesh
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AU - Harper, Lynda
AU - Mitchell, Jena
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AU - Sydes, Benjamin
AU - Clement, Louise
AU - Kay, Edward
AU - Courtney, Cheryl
AU - Gallagher, Madalena
AU - Murphy, Claire
AU - Thompson, Lindsay
AU - Beall, Sarah
AU - Hassan, Sharma
AU - Gracie, Richard
AU - Griffiths, Gareth
AU - Mason, Malcolm
AU - Parker, Chris
AU - Rudd, Robin
AU - Johnson, Patrick
AU - Whelan, Jeremy
AU - Northover, John
AU - Brown, Julia
AU - Aapro, Matti
AU - Stout, Ronald
AU - Midgley, Rachel
AU - Kerr, David J.
AU - Campbell, Harry
AU - Tomlinson, Ian P.
AU - Houlston, Richard S.
PY - 2012/7
Y1 - 2012/7
N2 - We performed a meta-analysis of five genome-wide association studies to identify common variants influencing colorectal cancer (CRC) risk comprising 8,682 cases and 9,649 controls. Replication analysis was performed in case-control sets totaling 21,096 cases and 19,555 controls. We identified three new CRC risk loci at 6p21 (rs1321311, near CDKN1A; P = 1.14 × 10 -10), 11q13.4 (rs3824999, intronic to POLD3; P = 3.65 × 10 -10) and Xp22.2 (rs5934683, near SHROOM2; P = 7.30 × 10 -10) This brings the number of independent loci associated with CRC risk to 20 and provides further insight into the genetic architecture of inherited susceptibility to CRC.
AB - We performed a meta-analysis of five genome-wide association studies to identify common variants influencing colorectal cancer (CRC) risk comprising 8,682 cases and 9,649 controls. Replication analysis was performed in case-control sets totaling 21,096 cases and 19,555 controls. We identified three new CRC risk loci at 6p21 (rs1321311, near CDKN1A; P = 1.14 × 10 -10), 11q13.4 (rs3824999, intronic to POLD3; P = 3.65 × 10 -10) and Xp22.2 (rs5934683, near SHROOM2; P = 7.30 × 10 -10) This brings the number of independent loci associated with CRC risk to 20 and provides further insight into the genetic architecture of inherited susceptibility to CRC.
UR - http://www.scopus.com/inward/record.url?scp=84863005628&partnerID=8YFLogxK
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M3 - Article
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SN - 1061-4036
VL - 44
SP - 770
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JF - Nature Genetics
IS - 7
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